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支氣管鏡檢查是由醫師使用軟式支氣管鏡（一條含光纖的管子）或硬式的支氣管鏡。支氣管鏡檢查的主要目的是因為有一些病兆存在氣管內，無法靠單純的胸部X光片來做診斷，有些是在電腦斷層檢查中發現病兆，需要靠支氣管鏡來做切片檢查確認病理報告；支氣管內有異物要靠支氣管鏡來夾取或對於有一些慢性疾病在胸部X光檢查中都沒有發現原因，有時也需做支氣管鏡檢查來找出原因。  

支氣管鏡檢查的事前準備包括了尋問吃藥的病史、胸部X光檢查、血液檢查、評估是否有發生併發症的機會。檢查時必須在一個有急救設備的治療室或手術室中進行，醫師會先給病人抑制氣管黏液分泌及減輕焦慮的藥物，有時會給一些讓病人稍微休息睡覺的藥物，同時幫病人裝上心電圖及血氧監視器，之後會將支氣管鏡深入支氣管中檢查。檢查後病人會被送到觀察室去，如果沒有出現出血或呼吸困難的情形，同時病人清醒後就可以出院了。
  
支氣管鏡檢查常見的併發症包括了氣胸及出血。  

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